2011 год. К 2011 году в Зоне действует крупная группировка, лидер которой – сталкер по кличке Стрелок, Антон Чернов. Он находит документы и карты, касающиеся подземного города под Припятью – крупнейшего, центрального комплекса лабораторий проекта «О-Сознание». Он берёт двух наиболее преданных людей – Клыка и Призрака и вместе с ними прорывается к ЧАЭС, обойдя систему защиты учёных. Им удаётся проникнуть в Саркофаг, где они упираются в дверь, ведущую в центральную лабораторию, в которой находится Объединённое Сознание. Декодера к двери нет, открыть её иным способ невозможно – и они решают вернуться, по пути собирают несколько уникальных артефактов, которые есть только в Центре Зоны. Однако около выходе из Саркофага их настигает очень сильный Выброс, посланный О-Сознанием с целью убить сталкеров. В результате Выброса закрываются проходы к заводу Росток и Бару на его территории, по всей Зоне возникают пространственные пузыри – пространственные и временные «дырки» в пространстве. Так же Сверхвыброс становится неким толчком – нервным импульсом для Ноосферы, утекающей в Зону через Пробои. В ней зарождается Информационный Разум, а О-Сознание теряет контроль над Ноосферой Зоны. Погибает «Мозговой Линк» - объединённый разум четверых руководителей О-Сознания, созданный незадолго до этого. Он поглощён выделившейся Ноосферой и трансформировался в Тёмную Невидимую Сущность – материализацию Разума Ноосферы. Открываются «закрытые» до сих пор проходы к новым территориям – Южным Болотам, Городу Призраков (Лиманск-13). Из-за потери старых и появления новых территорий в Зоне разгорается масштабная Война Группировок – главными противоборствующими силами выступают Долг и Свобода. Многие сталкеры и группы сталкеров оказываются заперты в «пузырях» - периодически можно услышать обрывки их просьб помощи по радиоволнам – однако, из-за того, что время в Пузырях идёт по-другому, невозможно определить, к какому времени относятся послания помощи. Незадолго до Выброса группа ООН-овских учёных наняла в качестве проводника одного из наёмников, по кличке Шрам. Его заданием было провести учёных к «Странному месту» - так стали называть сталкеры одну из областей Свалки, ровно под ней находилась лаборатория, в которой находился один из крупнейших Ноосферных пробоев. Выброс накрывает их в дороге. Судьба учёных неизвестна, а Шрама дублирует Ноосфера и копия оказывается на Южных Болотах, около секретной доселе базы «Чистого Неба». Одна из разведгрупп группировки подбирает еле живого Шрама (его копию) и относит на базу… Тем временем Клык и Призрак относят так же еле живого Стрелка к Доктору – его зацепило Выбросом. Доктор начинает его лечить, а сами Клык и Призрак отправляются искать элементы для дешифратора, который поможешь открыть закодированную дверь в Саркофаге. Они готовятся ко второму Прорыву. Шрама вылечивают и тут обнаруживается, что он устойчив к Выбросам – он может пережить аномальную активность, но с каждым новым Выбросом его нервная система всё более разрушается. Лебедев узнаёт, что недавно к Сидоровичу наведывался сталкер, интересовавшийся чем-то необычным. Глава Чистого Неба решает использовать Шрама, чтобы выйти на группу сталкеров, прорвавшуюся к Центру Зоны, чтобы по их пути прорваться к ЧАЭС и уничтожить учёных, руководящих объединённым разумом. Он ещё не знает, что О-Сознание потеряло контроль над Ноосферой и думает, что всё происходящее – дело рук его бывших коллег. Шрам отправляется на Кордон, где нападает на след Клыка. Он ведёт на Свалку, к Чёрному Копателю – к нему Сидорович отправил Клыка. Пока Шрам идёт до Свалки, сам Клык проникается к Копателю в тайник, убивает его и забирает необходимое, но на обратном пути его ранит кровосос. Притворившись Копателем перед Шрамом, не знавшим его в лицо, он отослал своего преследователя в ловушку – в тайник, а сам получил время уйти. В тайнике Шрам после убийства раненого кровососа находит фотографию ЧАЭС и списком необходимых деталей. Теперь он знает имя ещё одного члена группы Стрелка – Призрака, которому и было адресовано написанное на обратной стороне фотографии послание. Тут свалка начинает проседать и Шрам спешно выбирается из тайника на поверхность, где Лебедев ему сообщается, что начинается Выброс и скидывает координаты одного их проходов в подземелья Свалки – через железнодорожный тоннель. Шрам успевает проникнуть туда, однако всё равно теряет сознание по время Выброса. Буквально перед Выбросом Доктор заканчивает лечить Стрелка и тот отправляется к учёным на Янтарь, договариваясь с ними: он им помогает, а они предоставляют ему экспериментальный пси-шлем, способный защитить от пси-излучения. На этот раз группа Стрелка решает отправиться к Центру Зоны прямо через Выжигатель, а не через подземелья Припяти. Всё это время настоящий Шрам, как ни в чём не бывало, ходит по Зоне и даже помогает Клыку, спасая его в Тёмной Долине от бандитов, хотя и сам попадает в плен. Во время Выброса Шрам-копия обрывочно видит это – его сознание подключается к сознанию того, с кого оно было склонировано, и дубль видит сон, отрадающий недавние события, пережитые оригиналом После Выброса наёмник, обговорив планы с Лебедевым, решает отправиться далее по Катакомбам, в которых оказался – так безопаснее. Он едет по туннелям на дрезине и вскоре выезжает к разрушенному мосту через один из рукавов реки Припять. За рекой – холмы и НИИ Агропром. Шрам перебирается по опорам моста на тот берег и уже почти перебравшись спускается в небольшой проход около одной из опор моста. Этот проход ведёт в подземелья Агропрома. Здесь наёмник находит тайник группы Стрелка и узнаёт о нём самом. Тут же отправляет эту информацию Лебедеву. Чистое Небо теперь знает всех троих, знает их планы. Остаётся только опередить Стрелка и прорваться к Саркофагу раньше его… Шрам отправляется на Янтарь, чтобы перехватить там Стрелка. Тут он попадает в ловушку, устроенную Стрелком и Клыком. Клык «узнаёт» наёмника и сообщает, что тот «спас ему жизнь в Тёмной Долине» и сталкеры решают не убивать наёмника. Придя в себя, Шрам выполняет поручение Сахарова по охране бункера, в результате чего тот сообщает ему, что Стрелок и Клык приходили за экземпляром пси-шлема. Шрам связывается с Лебедевым, тот приказывает немедленно идти за Стрелком. Наёмник почти достигает сталкера, но близко к Лиманску теряет его. Шрам оказывается в Рыжем Лесу и видит, что чтобы пробраться в Лиманск – это единственный путь к Саркофагу (ведь единственный пси-шлем на Стрелке и он идёт через Радар), необходимо опустить мост на тот берег ещё одного рукава Припяти. Но на той стороне идёт активная перестрелка между Долгом и Свободой, которые воюют за территорию Лиманска и никого с этой стороны они тоже не подпускают. Лебедев сообщает, что Стрелок направляется на встречу с Призраком – получить от него собранный дешифратор и Чистое Небо попытается его перехватить. А Шрам должен подготовить запасной путь через Лиманск – для этого он советует поговорить с местной легендой – сталкером по кличке Лесник, который тут даже «партизанил против фашистов». Наёмник добирается к нему, пройдя через непосредственно Красный Лес. Старик (так ещё называют Лесника) узнаёт от Шрама последние события и соглашается помочь ему. Он рассказывает, что есть один человек – Картограф, его старый приятель, - который умеет чувствовать Зону, интуитивно находит проходы в пузырях и знает многие тайные тропы Зоны. Чтобы попасть к Картографу, необходимо собрать некий «ключ», состоящий из четырёх частей. Одну даёт сам Лесник, другие находятся на базах группировок. Первым делом Старик посылает Шрама на Агропром, базу Долга. Здесь наёмник получает вторую часть ключа, после чего отправляется на Свалку – там, по слухам, ещё одна часть ключа. Тут Шрам получает третью часть ключа от командира местной базы Свободы и отправляется за последней в Тёмную Долину, к бандитам. От лидера местной банды Шрам получается четвёртую часть. Собрав ключ, наёмник надевает его на руку (он одевается по принципу браслета) и активирует его. Активированный ключ показывает ему, куда идти, чтобы попасть к Картографу. Достигнув пространственного портала, Шрам попадает в Обитель Картографа. Сама Обитель – храм на холме, окружённом водой, находящихся в одном из пузырей. Сам Картограф человек неопределённых лет, ведущий отшельнический и подвижный образ жизни. Картограф помогает наёмнику, сообщая, что на том берегу реки есть пузырь, в котором застряла военная экспедиция. Если помочь им выбраться из пузыря, то они опустят мост. Текст с объяснением, как помочь группе, Картограф передаёт Шраму на флешке, добавляя, что связаться с группой можно попробовать через сильный передатчик на Милитари. Шрам связывается с группой, передавая необходимую информацию, после чего сообщается Лебедеву состояние дел. Тот говорит, что передовой отряд Чистого Неба уже подходит к мосту, наёмник направляется туда же. В это же время Призраку удаётся уйти из засады на Складах, устроенной ЧН, и передать Стрелку собранный дешифратор. Стрелок направляется через Выжигатель Мозгов к ЧАЭС. Военным удаётся выбраться из пузыря и они опускают мост в Лиманск – они сами спешат к Кордону, а боевые силы Чистого Неба во главе с Лебедевым и Шрамом переправляются на тот берег. В Лиманске бушует война между Долгом и Свободой – они сидят в разных половинах города, разделённых центральной аллеей. Шрам уничтожает ключевые снайперский и пулемётные точки обеих группировок в городе, обеспечивая ЧН возможность пересечь Лиманск. Далее единственный путь – через Технокапище – огромную систему подземных катакомб, не меньшую, чем подземный город Припяти. Часть путепроводов Технокапища выходит и на Свалку. Шрам отправляется вперёд отряда, исследуя проход по Катакомбам. По пути он видит заброшенные лаборатории, тоннели, трупы странных мутантов… Добравшись до железнодорожной развязки, встречается с морлоками. Так же Шрам встречает и лаборантов – мутировавших учёных и дублей – клонированных Ноосферой сталкеров, которые стремятся к ближайшему ноосферному прорыву – то есть к Алтарю Технокапища, которому поклоняются местные полумутанты. Добравшись до центрального Алтаря, на связь со Шрамом выходит Лебедев, который приказывает ему оставаться на месте до подхода отрядов Чистого Неба. В этот момент со всех сторон на наёмника начинают нападать мутанты. Через пару минут ему на помощь приходят ещё двое – боец Чистого Неба и неизвестный сталкер в плаще. Боец вскоре погибает и Шраму вместе с неизвестным удаётся продержаться до подхода боевиков ЧН. Пока Шрам находится без сознания, учёные ЧН обнаруживают, что второй сталкер – это оригинальный Шрам, а «их» наёмник – копия. Но оригинал уже умирает, а дубль вскоре приходит в себя. Лебедев сообщает, что они уже под ЧАЭС и Стрелок тоже где-то рядом. Шраму необходимо найти его и продержаться десять секунд около него со включённым электромагнитным импульсатором, чтобы отключить пси-шлем – тогда монолитовцы обнаружат и схватят Стрелка. Чистое Небо выходит на поверхность и с боем прорывается вплотную к станции. Стрелок уже тут как тут – ему остаются минуты, чтобы добраться до входа в Саркофаг. Шрам выполняет свою задачу, успевая отключить пси-защиту Стрелка. О-Сознание, обнаружив помимо отрядов Чистого Неба ещё и Стрелка, генерирует мощный Выброс, который накрывает поле боя около ЧАЭС. Стрелка и Шрама кодируют по программе «S.T.A.L.K.E.R.».
2011-2012. После гибели ударной группы Чистого Неба на ЧАЭС и прорыва Стрелка в Саркофаг сталкеры-ветераны Зоны собираются в группу и отправляются к Станции. Поскольку запасов еды у них было на две недели и никто из них в этот срок не вернулся, их посчитали погибшими. Учащаются Выбросы. Появляется Зов Зоны, который слышат все новички Зоны – этот Зов зовёт их в Сердце Зоны. Около ЧАЭС появляется неизвестной природы пси-воздействие. Его называют Ментальным огнём. На Болотах поставлена ещё одна научная лаборатория, как на Янтаре. Военные устраивают массовую вылазку в Зону – целый штурм Зоны. Цель – дойти до Саркофага и уничтожить причину появления Зоны. Путь военным прокладывают военсталы, за солдатами попятам идёт бронетехника. Всего в Зону ушло более тысячи солдат. Несколько военных групп всё-таки смогли прорваться за Выжигатель, что с ними стало потом – неизвестно. Ещё пара осели в Зоне, надеясь дождаться эвакуации – хотя надеяться им было не на что, не вернувшихся посчитали погибшими. Все остальные погибли прямо в Зоне, от рук мутантов, аномалий и группировок. Зона резко расширяется, захватывая тридцатикилометровую территорию вокруг города Варовска. Всех удалось эвакуировать. «Всплывают» некоторые учёные, ранее работавшие в лабораториях, но после образования Зоны сбежавшие оттуда. Один из них – Арнольд Николаевич, теперь – видный профессор, занимающийся исследованиями Зоны с Большой Земли. Есть и другие выжившие, не оставшиеся после катастрофы в проектах лабораторий. Например, один из бывших коллег Арнольда Николаевича, а теперь вольный одиночка – Одинокий Волк. Периодически он наведывается в близлежащие города, или даже уезжает в Киев, не оставаясь в Зоне постоянно. В Зоне сталкеры натыкаются в одном из разваленных бункеров дневник с огромным количеством информации о Зоне. Дневник быстро попал к учёным, оттуда – к военному командованию. Сразу же полетели звания, произошло несколько несчастных случаев – была в дневнике некая информация. Так же армейская карта территории вокруг реактора станции пополнилась кучей новых пометок, планов, проходов и просто полезных сведений. В связи с изменившейся ситуацией был послан запрос в Москву. Из Москвы тут же пришёл ответ с приказом ликвидировать всех, кто имел контакт с этим дневником, а тех, кто имел контакты 3-его уровня подготовить к отправке в Москву. 2012 год. Невдалеке от убежища торговца Вована по кличке Жаба ночью разбивается «грузовик смерти» - в него попадает молния. На следующее утро один из местных сталкеров находит на обломках грузовика еле живого сталкера и относит Жабе. В КПК полуживого сталкера находится только одна запись: «Убить Стрелка!!!». На одной из рук татуировка – «S.T.A.L.K.E.R.». Так же около сталкера на земле лежал пистолет и пули с выгравированной кличкой: «Смерть». Вскоре меченый приходит в себя, восстанавливается. Он ничего не помнит, даже кто он такой. Жаба рассказывает меченому, что слыхал и про Стрелка и про сталкера по кличке Смерть – он был лидером самой сильной сталкерской группировки, которую несколько лет назад под ноль уничтожил целый отряд меченых сталкеров, так же, как и сам меченый. Выжил только Смерть, забрав всю информацию, собранную группировкой за это время. Жаба сообщает сталкеру, что тому придётся отработать долг за спасение торговцу. Тут же неизвестный сталкер придумывает себе кличку – Мессер, поскольку на «первое» задание Жаба отправляет его только с ножом. Отправившись выполнять первое задание Жабы, Мессер по пути теряет сознание и видит сон – начинается Выброс, около ЧАЭС находится группа сталкеров. От станции разбегается море крыс, они наскакивают на сталкеров, выгрызая у них татуировки «S.T.A.L.K.E.R.». Один из сталкеров стреляет и стреляет в крыс, тут кто-то кричит «Стрелок!» - сталкер поворачивается и Мессер просыпается, не успев увидеть лица сталкера. Примерно в это время на блокпост военных на Кордоне нападет целая стая крыс – они под ноль выгрызают весь блокпост. Однако после следующего Выброса военные вновь занимают блокпост. Выполнив задание торговца, Мессер возвращается обратно и Жаба тут же даёт второе задание. Во время его выполнения Мессера вновь сваливает с ног сон-воспоминание. Ливень с грозой, по дороге едет грузовик смерти. Вдруг одна из молний попадает в него, он взрывается, раскалываются гробы, откуда вылезают сталкеры-зомби. У каждого на руке татуировка, текст которой не разобрать. Сталкеры мечутся среди горящих обломков грузовика, хрипя «Убить Стрелка!!!» - и идут прямо на Мессера… Тут он просыпается. Вскоре он встречается со сталкером по кличке Хорёк – тот уже знает, что Мессер – выживший с грузовика смерти и хочет убить Стрелка. Так же сообщает, что давно не видел Стрелка. Выполняя последнее, третье задание Жабы, Мессер встречается с ещё одним сталкером – Одиноким Волком, который тоже уже всё о нём знает понаслышке. Он сообщает Мессеру, что Стрелок «грохнул всю их группу» и удивляется, что Мессер не помнит, к какой группировке принадлежал. Вскоре после этой встречи Мессер решает передохнуть в одном из домов, где его вновь сковывает сон. По пустынному городу идёт взрослый мужчина и ребёнок, держась за руки. Их лица не видны – герой сна видит их со спины. Ребёнок поднимает голову и спрашивает: «А правда, что все тебя зовут Стрелок?». Взрослый не успевает ответить, начинается Выброс – ребёнок вдруг превращается в мутанта и убегает, а город заполоняют полчища серых крыс. Перед тем, как отправляться вглубь Зоны, Жаба советует меченому выполнить для него задание, дабы подзаработать денег. Мессер соглашается и отправляется на хуторок за насыпью. Тут он видит очередной, четвёртый сон. На этот раз он снова видит ЧАЭС и начало Выброса. Только на этот раз от станции разбегаются толпы однообразных людей с изуродованными лицами. Вопреки общему течению стоит человек, распластав руки крестом, словно хочет остановить толпу. Звучит выстрел и человек падает, его тут же втаптывают в грязь… Шакал, с которым Мессер выходит на связь по поручению Жабы, сообщает ему, что недавно на Кордон прибыл ещё один грузовик смерти, в котором теперь несколько выживших сталкеров – все они ищут Мессера, чтобы убить. Так же он говорит, что тёмные сталкеры боятся Мессера, а некоторые возлагают на него надежды. И рассказывает миф, что трижды воскресший доберётся до Сердца Зоны. Выбравшись с Кордона в основную Зону, Мессер попал на территорию Свалки, где на некоторое время присоединился к мобильной группе Долга под руководством Сторожевого Пса. Однако вскоре Мессеру приходится уйти – за ним попятам следуют тёмные сталкеры и меченые с грузовиков смерти, закодированные на его убийство. К этому времени в Зоне внезапно объявляется вернувшаяся экспедиция сталкеров-ветеранов, которые почти год назад ушли к ЧАЭС. На связь с Мессером выходит Одинокий Волк и советует ему отправиться в Тёмную Долину за бумагами для бармена «100 рентген» - Крыса – тогда Мессера пустят в Бар, где его в принципе ждут. Но тот решает отправиться вначале на Агропром, на одной из баз которого хозяйничает Чистое Небо. Пробегая по территории около НИИ Мессер ловит сигнал SOS, поступающий от представителя почти вымершего клана «Толкиенутых» по кличке Гоплит. Мессер помогает сталкеру, за что тот ему рассказывает интересную информацию – что полгода назад все дети из окрестных сёл ушли в Зону. Дело замяли, но один парень занялся собственным журналистским расследованием. Его так и прозвали – Журналист. Он нанял в помощь себе Стрелка. Сначала Журналист что-то долго искал на Агропроме, а вскоре после этого вместе со Стрелком ушёл к Центру Зоны. По пути к зданию НИИ Мессер вновь видит видение с мужчиной и ребёнком. В зданиях института Мессер нашёл немного бумаг, относящихся к системе поставок материалов сети «X» и стал возвращаться обратно. На обратном пути он обнаружил, что Гоплита убили. Тут Мессер вспоминает ещё одну картину из прошлого - просторная подземная лаборатория, много карликов. Сталкер, чего лица не видно, подходит к стене, карлики разбегаются от него с визгом. Он берёт осколок кирпича и пишет на стене «Стрелок» (ранее Мессер видел уже надписи «Стрелок» на стенах, на оконных рамах). Недалеко от места убийства Гоплита Мессер обнаруживает ещё одного сталкера. Его приходится убить. Обыскав его, Мессер обнаруживает, что тот из Наёмников – кто-то «заказал» Мессера. Так же этот наёмник убил и Гоплита. В схроне около обнаруживаются ещё бумаги, связанные с теми, что меченый нашёл на Агропроме – среди них бумаги про лабораторию №6 и установки РД-100. И вновь видение: морг, куча столов, на них трупы, закрытые простынями. Входят двое в белых халатах и марлевых повязках. Один из них заглядывает под одну из простыней и говорит «Отвоевался Стрелок». Вскоре на Мессера выходит Вороний Глаз – бывший долговец, вместе с которым Мессер защищал Свалку. Тот сообщает, что вскоре после ухода Мессера на их базу напал отряд наёмников. Он просит Мессера взять его с собой, но тот отказывает. Примерно в это время Мессер видит очередной сон-воспоминание. Герой сна идёт по городу, нет ни мутантов, ни Зоны. Герой заходит в один из домов. Спиной к герою стоит человек. Он оборачивается и герой узнаёт себя самого. Обернувшийся говорит: «Ну здравствуй, Стрелок»… Теперь его цель – найти базу Наёмников, чтобы там попытаться что-то выведать. Он направляется в район Милитари. Пробираясь на заброшенные склады – базу наёмников – Мессер сталкивается с одним из меченых: на правой руке видна татуировка «S.T.A.L.K.E.R.», сам меченый идёт тупо, бездумно, бормоча под нос «убить Стрелка», «убить Мессера» и т.п. Тут на базу Убийц нападают несколько зомби-меченых, начинается суматоха. Мессер пробирается как можно ближе к центральным зданиям, вглубь базы, и тут начинается Выброс. Мессер успел забежать в подвал неподалёку. Тут происходит не очень обычное событие – встретившийся ему Чернобыльский Пёс не обращает на него внимания, не пытаясь даже напасть просто уходит от сталкера. Выбравшись из подвала, Мессеру удаётся подглядеть разговор главы наёмников с военным сталкером в экзоскелете – оказывается, заказы на него поступают откуда-то от военных. Меченый выбирается с базы и направляется в лабораторию №6. Тут у него возникает чувство де-жа-вю и он идёт по лаборатории, как будто уже неоднократно в ней был – даже подсознательно помнит, где какие мутанты встречаются, равно как и тайники с медикаментами. В одном из подвалов лаборатории Мессер обнаруживает целый курган, наподобие аналогичного в Технокапище. Только это значительно меньше и сложено из компьютерных мышек. Рядом находятся и другие похожие курганы – только из других вещей. Тут Мессер встретил невидимок, которые объяснили ему назначение курганов – каждый из них могила для души сталкера, поэтому в основании кургана лежит пронзённый КПК. Мессер добирается до кургана с бумагами и собирается их забрать, но тут на него нападают мелкие существа, напоминающие карликов – они швыряются в него чем попало. Успев забрать немногое, Мессер бежал из лаборатории. Вскоре Мессер узнаёт ещё больше о Журналисте от сталкеров – вроде как тот раскапывал военные архивы и, кроме того, что искал пропавших в Зоне детей, искал ещё Международный Исследовательский Центр (в существовании которого уверены все, но никто его не видел, как и базу Синдиката или Греха). Мессер направляется к учёным на Янтарь, стараясь выяснить информацию про Журналиста – по слухам, он сотрудничал и с Сахаровым. Учёные отправляют его в Мёртвый Город – вроде как Журналист направился именно туда. Мессер отправляется к нему через завод Росток, где его ловят сталкеры «Греха». Его берут в плен и готовят к какой-то их шаманской церемонии, глава фанатиков говорит Мессеру, что тот – уже дважды рождён. Меченому удаётся вырваться из плена и с боем сбежать с базы фанатиков. Во время боя Мессер вдруг начинает слышать чей-то инородный голос в своей голове, который и впоследствии слышит в критические моменты – он с ним общается посредством мыслей. Мессер вновь видит сон, про Журналиста. Тот стоит и роется в каких-то бумагах на заводе. Вдали крадётся какой-то сталкер с винтовкой. Он останавливается, прицеливается и стреляет. На пол рядом с Журналистом падает труп какого-то мутанта. Он отрывается от бумаг, произнося: «Это ты, Стрелок?». Он продолжает путь к Мёртвому Городу, на окраинах которого находится Свобода. В городе Мессер общается с зомби, стараясь выведать информацию о Журналисте из их сумасшедшего бреда. Про Журналиста они говорят, что он хороший, а при имени Стрелка впадают в ужас и убегают. Мессер не узнаёт ничего путного, кроме того, что оба искомых ими сталкера были тут. Тут ему снится сон про Доктора: огромная заболоченная равнина, куча трупов. Среди них ходит Доктор и переворачивает трупы, пытаясь найти кого-то. Один из мертвецов вдруг подаёт признаки жизни, Доктор подходит к нему, вспарывает рукав комбеза и видит татуировку «S.T.A.L.K.E.R.». Он взваливает сталкера на плечи и куда-то уносит. Выбравшись из Мёртвого Города, Мессер направляется на Северные болота около города. Тут он и встречает Доктора. Доктор узнаёт его и сообщает, что он – Стрелок. Добравшись до дома Доктора, Стрелок падает в беспамятстве и видит ещё один сон – сталкер около Чёрного Монолита, раненый, тянет руку к камню… Вспышка и вновь самый первый сон, но прокрученный как кинолента с конца в начало. Когда Стрелок приходит в себя, Доктор рассказывает ему, что тот ходил за Припять, к станции, после чего Доктор собирал его «по частям» - а Стрелок ему рассказывал про Чёрный Монолит, который видел и отдал фотографию ЧАЭС. После чего тот вновь направился к Станции. С новыми знаниями и воспоминаниями Стрелок решает отправиться вновь к ЧАЭС. Для этого он при помощи учёных (Сахаров вновь даёт ему пси-шлем) отключает Выжигатель на Радаре и проникает в Припять. Получив информацию, что Выжигатель отключён и сталкеры массово ринулись к Центру Зоны, СБУ начинает операцию «Фарватер», посылая вертолёты с десантов по заранее выверенным картам аномальных зон. Три вертолёта гибнут на подлётах к Припяти в аномалиях, сместившихся после последнего Выброса, ещё два сбивают снайперы Монолита из Припяти. Стрелок проникает в Припять. Здесь он прорывается через толпы монолитовцев и зомби, у всех одна сознательная или нет цель – убить Стрелка. Но он прорывается к станции, которую уже начинают штурмовать выжившие вертолёты, посланные СБУ. О-Сознание вновь посылает Выброс, намереваясь убить и Стрелка, и военных. Но Стрелок успевает проникнуть в Саркофаг.
Тут его «внутренний голос» «напоминает» ему, что на пути к Монолиту его ждёт три препятствия – зал с растениями-мутантами, огненный мост и супермонстр. Так же голос говорит, что в первый раз тот дошёл до супермонстра, а во второй даже не дошёл до моста. На грани жизни Мессеру-Стрелку удаётся пройти все три препятствия. Он стоит на грани комнаты с Монолитом. Но его память пробудилась, он уже многое помнил, он читал записи, сделанные Журналистом. Он не пошёл к Монолиту и направился в центральную Лабораторию О-Сознания. Примерно в это время, вскоре после фиаско штурма ЧАЭС, как можно ближе к ЧАЭС, на Затон переправлен сотрудник СБУ майор Дегтярёв, из бывших сталкеров. Он занимается расследованием гибели вертолётов. Так же в Зону активно проникают слухи о том, что началась гражданская война при попытке стран СНГ объединиться в Славянский союз. Сталкеры по открывшемуся к Центру Зоны проходу массово идут на Затон, в окрестности завода Юпитер и железнодорожной станции Янов. Учёные мгновенно разворачивают в этих краях ещё один научный бункер. Сюда идут Долг и Свобода, вольные сталкеры и бандиты – и даже некоторые выжившие из Чистого Неба. Находящийся в Центральной Лаборатории проекта Стрелок видит, что по лаборатории ходят дети – те самые, которые пропали в Зоне. Появляется один из учёных, который говорит сталкеру, что лаборатория пытается уничтожить Зону, исправить последствия аварии. Однако вскоре один из детей рассказывает Стрелку «правду», что лаборатория поддерживает существование Зоны. Стрелок проникает в центральный отсек, в котором лежат тела людей, объединённых в единый Разум. Он убивает всех и уничтожает аппаратуру. Стрелок собирается вывести из лаборатории детей – однако тут один из детей поедает живую крысу и сталкер видит в глазах детей отблеск Чёрного Монолита… Дети оказываются уже подвергнуты биопсихическим мутациям – они, как в одном из снов, превращаются в мутантов и разбегаются. В Саркофаге начинается что-то непонятное и Стрелок убегает со станции. Стрелок решает направиться в Припять. Около станции он встречает своего старого друга – Проводника. Тот даёт ему наводку на секретные путепроводы, ведущие в Припять. Это спасает Стрелка от начинающегося Выброса. После Выброса бывший Мессер добирается до Припяти. Тут Стрелка встречает майор Дегтярёв и полковник Ковальский. На помощь застрявшим в Припяти сталкерам военные посылают вертолёты для эвакуации. О-Сознание пытается вдогонку убить таки сталкеров, послав в Припять кучу зомби и мутантов, а так же отряды Монолита. Но военным и Стрелку удаётся пробиться к вертолётам и улететь из Зоны. 2012-2013. Майору Дегтярёву присваивают внеочередное звание полковника, однако он отказывается от штабной работы и идёт в Зону «наблюдателем» - по сути вновь становится сталкером, Зов Зоны даёт о себе знать. Стрелок создаёт НИИ ЧАЗ. Он знает больше, чем рассказывает военным. Поняв, что с гибелью О-Сознания Зона не пропала, он решает во что бы то ни стало докопаться до причины этого и уничтожить её. Сам Стрелок так до сих пор и не вспомнил всю свою жизнь – только чётко помнит те моменты своей биографии, о которых ему рассказали. Это ещё один стимул для него уничтожить Зону. 2013. Исследования, проводимые НИИ ЧАЗ, дают результат и Стрелок решает вернуться в Зону – теперь он уверен, что знает причину того, что Зона осталась и знает как её уничтожить раз и навсегда. При поддержке военной экспедиции он проникает сразу близко к Станции, однако тут его схватывают монолитовцы. Несмотря на гибель Объединённого Разума, у учёных О-Сознания осталось в рабочем состоянии другое оборудование – пси-установки, их личные способности, приобретённые из-за работы с Ноосферой, системы кодирования агентов… Стрелка вывозят на грузовике смерти на Кордон – на этот раз никакого сбоя, просто его посчитали погибшим. Где-то в Зоне грузовик попадает под плановый Выброс, который не убивает вновь «оживающего» Стрелка. Он сам быстро приходит в сознание. Выброс открыл ему закодированные участки памяти. Теперь он вспомнил всё. И теперь он «трижды рождённый». Он идёт к ЧАЭС – на этот раз никто не способен его остановить, он знает наизусть каждый камешек по дороге к атомной Станции. В Саркофаге теперь нет Центральной Лаборатории – она уничтожена. Стрелок – Антон Чернов – идёт к Монолиту. Но не загадать желание. Около Монолита находится секретная комната. Из неё три выхода – два ложных, иллюзорных. Антон выбирает единственный правильный выход – он ведёт в тёмную комнату в Нигде. Здесь обитает Невидимая Сущность – тот самый возникший в Ноосфере ещё в 2011-м году Разум. Происходит тяжёлый психологический монолог, после которого Сущность позволяет Антону пройти дальше – он оказывается в Центре Управления, где отключает напрочь все оставшиеся работать Генераторы, которые создавались ещё в 90-хх для поддержания стабильности Чёрного Монолита, который так и остался загадкой даже для учёных из О-Сознания. Чернов «отключает» Монолит. Зона резко исчезает, происходит анти-Выброс, в результате которого гибнет и зародившийся в Ноосфере Разум. Стрелок выходит из Саркофага – кажется, что Зоны уже нет и не будет. Но сам Чернов ещё не знает о том, что теперь он – переносчик Зоны, он не уничтожил странный Чёрный Монолит – теперь его частичка и в нём. В результате анти-Выброса отключились системы, поддерживающий анабиоз Постчеловека. Он пробуждается и выходит из завалов бывшего НИИП. Тут его, как ни в чём не бывало, ждёт контроллёр. Между ними происходит короткая битва и контролёр берёт Постчеловека под контроль. Глаза Постчеловека гаснут, он сломлен. Стрелок проваливается во тьму, его сознание теперь – Зона. Он добредает до Сидоровича, пытается ему объяснить про опасность, про сверхсекретные сведения для правительств всего мира. В следующие минуты Антон оказывается на блокпосте на выходе из Зоны. За секунды до этого он сквозь тьму слышал нечеловеческий полу-крик, теперь он видит – все военные вокруг лежат, закрыв уши и перекосив лица от ужаса, все они мертвы. После выхода с блокпоста Стрелка встречает военный спецотряд, кто-то из полевых учёных воздействует на него каким-то особым передатчиком. Он «засыпает». Через несколько дней Антона, без сознания, вносят в теле-аудиторию. Идёт телепрограмма «Мир и сталкер», по всем показателям он должен очнуться. Все с нетерпением ждут этого момента… Стрелок «просыпается». Вновь нечеловеческий полу-крик… Президенты стран, правительства, миллиона зрителей – все, кто в этот момент находились у экранов телевизоров либо около иных устройств, передающих телепередачу, мертвы. Появляется новая Зона. Теперь она в несколько раз больше, она заглатывает целые города, а некоторые из городов, которые должны были послужить экспериментальным материалом психотропного оружия, разрабатываемого в НИИП, получают пси-ключ – код, по которому активируются пробные образцы этого пси-оружия. Целые города превращаются в зомби…
